Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnc1P19123 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnc1P19123 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnc1P19123 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnc1P19123 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnc1P19123 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnc1P19123 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnc1P19123 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnnc1P19123 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnnc1P19123 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnnc1P19123 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnnc1P19123 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnnc1P19123 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnnc1P19123 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnc1P19123 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms