Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxb1P17919 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxb1P17919 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxb1P17919 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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