Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ass1P16460 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ass1P16460 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ass1P16460 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ass1P16460 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ass1P16460 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ass1P16460 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ass1P16460 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ass1P16460 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ass1P16460 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ass1P16460 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ass1P16460 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ass1P16460 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ass1P16460 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ass1P16460 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ass1P16460 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ass1P16460 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ass1P16460 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ass1P16460 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ass1P16460 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ass1P16460 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ass1P16460 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ass1P16460 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ass1P16460 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ass1P16460 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ass1P16460 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ass1P16460 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ass1P16460 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ass1P16460 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ass1P16460 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ass1P16460 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ass1P16460 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ass1P16460 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ass1P16460 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ass1P16460 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ass1P16460 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ass1P16460 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ass1P16460 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ass1P16460 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ass1P16460 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ass1P16460 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ass1P16460 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ass1P16460 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ass1P16460 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ass1P16460 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ass1P16460 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ass1P16460 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ass1P16460 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ass1P16460 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ass1P16460 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ass1P16460 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ass1P16460 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ass1P16460 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ass1P16460 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ass1P16460 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms