Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kcna1P16388 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcna1P16388 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcna1P16388 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcna1P16388 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcna1P16388 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcna1P16388 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcna1P16388 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcna1P16388 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcna1P16388 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcna1P16388 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcna1P16388 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcna1P16388 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcna1P16388 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcna1P16388 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcna1P16388 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcna1P16388 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcna1P16388 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcna1P16388 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcna1P16388 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms