Protein–RNA interactions for Protein: P14097

Ccl4, C-C motif chemokine 4, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl4P14097 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccl4P14097 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccl4P14097 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccl4P14097 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccl4P14097 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccl4P14097 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccl4P14097 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccl4P14097 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccl4P14097 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccl4P14097 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccl4P14097 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccl4P14097 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccl4P14097 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccl4P14097 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccl4P14097 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccl4P14097 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccl4P14097 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccl4P14097 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccl4P14097 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccl4P14097 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccl4P14097 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccl4P14097 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccl4P14097 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccl4P14097 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccl4P14097 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccl4P14097 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccl4P14097 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccl4P14097 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccl4P14097 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccl4P14097 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccl4P14097 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccl4P14097 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccl4P14097 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccl4P14097 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccl4P14097 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccl4P14097 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccl4P14097 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccl4P14097 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccl4P14097 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccl4P14097 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccl4P14097 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccl4P14097 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccl4P14097 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccl4P14097 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccl4P14097 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccl4P14097 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccl4P14097 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccl4P14097 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccl4P14097 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccl4P14097 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccl4P14097 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccl4P14097 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccl4P14097 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccl4P14097 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccl4P14097 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccl4P14097 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccl4P14097 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccl4P14097 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccl4P14097 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccl4P14097 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccl4P14097 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccl4P14097 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccl4P14097 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccl4P14097 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccl4P14097 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccl4P14097 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccl4P14097 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccl4P14097 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccl4P14097 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccl4P14097 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccl4P14097 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccl4P14097 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccl4P14097 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccl4P14097 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccl4P14097 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccl4P14097 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccl4P14097 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccl4P14097 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccl4P14097 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccl4P14097 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccl4P14097 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccl4P14097 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccl4P14097 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccl4P14097 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccl4P14097 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccl4P14097 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccl4P14097 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccl4P14097 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccl4P14097 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccl4P14097 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccl4P14097 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccl4P14097 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccl4P14097 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccl4P14097 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccl4P14097 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms