Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nr4a1P12813 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms