Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DmdP11531 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DmdP11531 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DmdP11531 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DmdP11531 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DmdP11531 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DmdP11531 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DmdP11531 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DmdP11531 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DmdP11531 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DmdP11531 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DmdP11531 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DmdP11531 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DmdP11531 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DmdP11531 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DmdP11531 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DmdP11531 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DmdP11531 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DmdP11531 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DmdP11531 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DmdP11531 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DmdP11531 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DmdP11531 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DmdP11531 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DmdP11531 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DmdP11531 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DmdP11531 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DmdP11531 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DmdP11531 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DmdP11531 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DmdP11531 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DmdP11531 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DmdP11531 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DmdP11531 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DmdP11531 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DmdP11531 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DmdP11531 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DmdP11531 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DmdP11531 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DmdP11531 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DmdP11531 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DmdP11531 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DmdP11531 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DmdP11531 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DmdP11531 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DmdP11531 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DmdP11531 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DmdP11531 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DmdP11531 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DmdP11531 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DmdP11531 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DmdP11531 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DmdP11531 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DmdP11531 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DmdP11531 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DmdP11531 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DmdP11531 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DmdP11531 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DmdP11531 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DmdP11531 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DmdP11531 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DmdP11531 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DmdP11531 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DmdP11531 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DmdP11531 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DmdP11531 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DmdP11531 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DmdP11531 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DmdP11531 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DmdP11531 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DmdP11531 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DmdP11531 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DmdP11531 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DmdP11531 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DmdP11531 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DmdP11531 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DmdP11531 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DmdP11531 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DmdP11531 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DmdP11531 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DmdP11531 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DmdP11531 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DmdP11531 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DmdP11531 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DmdP11531 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DmdP11531 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DmdP11531 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DmdP11531 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DmdP11531 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DmdP11531 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DmdP11531 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DmdP11531 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DmdP11531 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DmdP11531 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DmdP11531 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DmdP11531 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DmdP11531 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DmdP11531 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DmdP11531 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DmdP11531 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms