Protein–RNA interactions for Protein: P10605

Ctsb, Cathepsin B, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsbP10605 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsbP10605 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsbP10605 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsbP10605 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsbP10605 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsbP10605 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsbP10605 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsbP10605 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsbP10605 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtsbP10605 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CtsbP10605 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtsbP10605 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsbP10605 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsbP10605 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsbP10605 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsbP10605 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsbP10605 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms