Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CatspereP0DP43 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CatspereP0DP43 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CatspereP0DP43 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CatspereP0DP43 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CatspereP0DP43 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CatspereP0DP43 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CatspereP0DP43 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CatspereP0DP43 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CatspereP0DP43 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CatspereP0DP43 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CatspereP0DP43 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CatspereP0DP43 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CatspereP0DP43 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CatspereP0DP43 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CatspereP0DP43 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CatspereP0DP43 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CatspereP0DP43 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CatspereP0DP43 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CatspereP0DP43 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CatspereP0DP43 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CatspereP0DP43 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CatspereP0DP43 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CatspereP0DP43 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CatspereP0DP43 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CatspereP0DP43 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CatspereP0DP43 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CatspereP0DP43 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CatspereP0DP43 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CatspereP0DP43 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CatspereP0DP43 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms