Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax1P09084 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax1P09084 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax1P09084 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax1P09084 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax1P09084 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax1P09084 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax1P09084 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pax1P09084 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax1P09084 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax1P09084 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax1P09084 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax1P09084 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax1P09084 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms