Protein–RNA interactions for Protein: P09041

Pgk2, Phosphoglycerate kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgk2P09041 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pgk2P09041 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pgk2P09041 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pgk2P09041 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pgk2P09041 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pgk2P09041 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pgk2P09041 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pgk2P09041 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pgk2P09041 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pgk2P09041 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pgk2P09041 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pgk2P09041 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pgk2P09041 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pgk2P09041 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pgk2P09041 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pgk2P09041 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pgk2P09041 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pgk2P09041 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pgk2P09041 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pgk2P09041 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pgk2P09041 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pgk2P09041 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pgk2P09041 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pgk2P09041 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pgk2P09041 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pgk2P09041 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pgk2P09041 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pgk2P09041 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pgk2P09041 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pgk2P09041 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pgk2P09041 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pgk2P09041 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pgk2P09041 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pgk2P09041 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pgk2P09041 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pgk2P09041 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pgk2P09041 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pgk2P09041 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pgk2P09041 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pgk2P09041 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pgk2P09041 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pgk2P09041 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pgk2P09041 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pgk2P09041 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pgk2P09041 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pgk2P09041 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pgk2P09041 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pgk2P09041 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pgk2P09041 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Pgk2P09041 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pgk2P09041 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Pgk2P09041 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pgk2P09041 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pgk2P09041 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pgk2P09041 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pgk2P09041 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pgk2P09041 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pgk2P09041 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pgk2P09041 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pgk2P09041 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pgk2P09041 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pgk2P09041 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms