Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc8P09025 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc8P09025 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc8P09025 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc8P09025 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc8P09025 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc8P09025 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc8P09025 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc8P09025 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc8P09025 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc8P09025 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc8P09025 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc8P09025 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc8P09025 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc8P09025 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc8P09025 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc8P09025 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc8P09025 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc8P09025 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc8P09025 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxc8P09025 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxc8P09025 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxc8P09025 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxc8P09025 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxc8P09025 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxc8P09025 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxc8P09025 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxc8P09025 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxc8P09025 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxc8P09025 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Hoxc8P09025 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxc8P09025 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxc8P09025 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxc8P09025 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxc8P09025 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxc8P09025 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxc8P09025 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxc8P09025 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxc8P09025 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxc8P09025 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxc8P09025 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc8P09025 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc8P09025 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc8P09025 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc8P09025 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc8P09025 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc8P09025 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxc8P09025 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxc8P09025 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxc8P09025 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc8P09025 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc8P09025 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc8P09025 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc8P09025 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc8P09025 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc8P09025 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxc8P09025 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxc8P09025 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxc8P09025 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxc8P09025 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxc8P09025 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxc8P09025 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxc8P09025 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxc8P09025 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms