Protein–RNA interactions for Protein: P07744

Krt4, Keratin, type II cytoskeletal 4, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt4P07744 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt4P07744 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt4P07744 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt4P07744 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt4P07744 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt4P07744 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt4P07744 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt4P07744 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt4P07744 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt4P07744 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt4P07744 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt4P07744 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt4P07744 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt4P07744 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt4P07744 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt4P07744 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt4P07744 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt4P07744 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt4P07744 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt4P07744 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt4P07744 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt4P07744 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt4P07744 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt4P07744 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt4P07744 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt4P07744 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt4P07744 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt4P07744 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt4P07744 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt4P07744 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt4P07744 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt4P07744 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt4P07744 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt4P07744 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt4P07744 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt4P07744 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt4P07744 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt4P07744 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt4P07744 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt4P07744 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt4P07744 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt4P07744 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt4P07744 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt4P07744 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt4P07744 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt4P07744 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt4P07744 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt4P07744 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt4P07744 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt4P07744 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt4P07744 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt4P07744 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt4P07744 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt4P07744 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt4P07744 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt4P07744 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt4P07744 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt4P07744 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt4P07744 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt4P07744 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt4P07744 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt4P07744 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt4P07744 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt4P07744 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt4P07744 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt4P07744 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt4P07744 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt4P07744 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt4P07744 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt4P07744 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt4P07744 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt4P07744 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt4P07744 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt4P07744 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt4P07744 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt4P07744 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Krt4P07744 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt4P07744 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt4P07744 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt4P07744 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt4P07744 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt4P07744 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt4P07744 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt4P07744 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt4P07744 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt4P07744 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt4P07744 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt4P07744 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt4P07744 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt4P07744 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Krt4P07744 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt4P07744 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt4P07744 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt4P07744 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt4P07744 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt4P07744 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt4P07744 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt4P07744 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt4P07744 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt4P07744 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 209.5 ms