Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifna4P07351 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna4P07351 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ifna4P07351 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna4P07351 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna4P07351 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna4P07351 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna4P07351 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna4P07351 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna4P07351 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna4P07351 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna4P07351 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna4P07351 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna4P07351 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna4P07351 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna4P07351 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna4P07351 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna4P07351 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna4P07351 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna4P07351 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna4P07351 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna4P07351 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna4P07351 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna4P07351 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna4P07351 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna4P07351 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifna4P07351 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna4P07351 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna4P07351 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna4P07351 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna4P07351 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifna4P07351 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms