Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TnfP06804 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TnfP06804 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TnfP06804 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TnfP06804 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TnfP06804 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TnfP06804 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TnfP06804 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TnfP06804 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TnfP06804 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TnfP06804 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TnfP06804 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TnfP06804 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TnfP06804 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TnfP06804 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TnfP06804 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TnfP06804 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TnfP06804 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TnfP06804 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TnfP06804 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TnfP06804 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TnfP06804 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TnfP06804 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TnfP06804 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TnfP06804 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TnfP06804 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TnfP06804 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TnfP06804 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TnfP06804 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TnfP06804 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TnfP06804 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TnfP06804 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TnfP06804 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TnfP06804 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TnfP06804 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TnfP06804 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TnfP06804 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TnfP06804 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TnfP06804 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TnfP06804 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TnfP06804 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TnfP06804 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TnfP06804 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TnfP06804 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TnfP06804 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TnfP06804 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TnfP06804 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TnfP06804 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TnfP06804 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TnfP06804 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TnfP06804 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TnfP06804 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TnfP06804 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TnfP06804 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TnfP06804 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TnfP06804 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TnfP06804 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TnfP06804 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TnfP06804 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TnfP06804 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TnfP06804 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TnfP06804 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TnfP06804 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TnfP06804 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TnfP06804 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TnfP06804 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TnfP06804 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TnfP06804 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TnfP06804 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TnfP06804 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TnfP06804 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TnfP06804 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TnfP06804 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TnfP06804 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TnfP06804 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TnfP06804 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TnfP06804 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TnfP06804 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TnfP06804 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TnfP06804 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TnfP06804 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TnfP06804 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TnfP06804 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TnfP06804 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TnfP06804 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TnfP06804 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TnfP06804 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TnfP06804 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TnfP06804 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TnfP06804 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TnfP06804 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TnfP06804 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TnfP06804 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TnfP06804 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TnfP06804 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TnfP06804 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TnfP06804 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TnfP06804 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TnfP06804 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TnfP06804 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms