Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxa4P06798 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxa4P06798 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa4P06798 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa4P06798 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms