Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P06323 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P06323 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P06323 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P06323 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
P06323 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
P06323 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P06323 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P06323 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P06323 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
P06323 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
P06323 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P06323 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
P06323 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P06323 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P06323 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P06323 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P06323 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P06323 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P06323 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P06323 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P06323 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P06323 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P06323 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P06323 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P06323 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P06323 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P06323 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P06323 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P06323 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P06323 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P06323 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P06323 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P06323 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P06323 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P06323 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P06323 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P06323 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P06323 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P06323 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P06323 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
P06323 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P06323 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P06323 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
P06323 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P06323 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P06323 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P06323 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P06323 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P06323 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P06323 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P06323 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P06323 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P06323 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P06323 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
P06323 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P06323 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P06323 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P06323 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P06323 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P06323 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P06323 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P06323 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P06323 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
P06323 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P06323 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P06323 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P06323 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P06323 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P06323 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P06323 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P06323 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P06323 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P06323 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
P06323 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
P06323 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P06323 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
P06323 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P06323 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P06323 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P06323 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P06323 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P06323 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P06323 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P06323 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P06323 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P06323 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P06323 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P06323 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P06323 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P06323 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P06323 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P06323 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P06323 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P06323 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P06323 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P06323 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P06323 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P06323 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P06323 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms