Protein–RNA interactions for Protein: P04235

Cd3d, T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3dP04235 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cd3dP04235 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cd3dP04235 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cd3dP04235 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cd3dP04235 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cd3dP04235 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cd3dP04235 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cd3dP04235 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cd3dP04235 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cd3dP04235 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cd3dP04235 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cd3dP04235 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cd3dP04235 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cd3dP04235 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cd3dP04235 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cd3dP04235 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cd3dP04235 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cd3dP04235 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cd3dP04235 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cd3dP04235 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cd3dP04235 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cd3dP04235 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cd3dP04235 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cd3dP04235 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cd3dP04235 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cd3dP04235 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cd3dP04235 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cd3dP04235 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cd3dP04235 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cd3dP04235 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cd3dP04235 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cd3dP04235 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cd3dP04235 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cd3dP04235 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cd3dP04235 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cd3dP04235 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cd3dP04235 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cd3dP04235 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cd3dP04235 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cd3dP04235 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cd3dP04235 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cd3dP04235 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cd3dP04235 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cd3dP04235 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cd3dP04235 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cd3dP04235 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cd3dP04235 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cd3dP04235 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cd3dP04235 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cd3dP04235 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cd3dP04235 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cd3dP04235 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cd3dP04235 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cd3dP04235 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cd3dP04235 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cd3dP04235 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cd3dP04235 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms