Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-Eb1P04230 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2-Eb1P04230 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms