Protein–RNA interactions for Protein: P01843

Ig lambda-1 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01843 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01843 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01843 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01843 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01843 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01843 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01843 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01843 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01843 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01843 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01843 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01843 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01843 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01843 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01843 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01843 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01843 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01843 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01843 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01843 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01843 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01843 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01843 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01843 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01843 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01843 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01843 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01843 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01843 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01843 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01843 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01843 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01843 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01843 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01843 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01843 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01843 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01843 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01843 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01843 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01843 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01843 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01843 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01843 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01843 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01843 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01843 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01843 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01843 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01843 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01843 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01843 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01843 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01843 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01843 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01843 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01843 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01843 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01843 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01843 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01843 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01843 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01843 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01843 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
P01843 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01843 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01843 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01843 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01843 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01843 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01843 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01843 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01843 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01843 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01843 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01843 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01843 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01843 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01843 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01843 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01843 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01843 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01843 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01843 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01843 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01843 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01843 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01843 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
P01843 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01843 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01843 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01843 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01843 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01843 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01843 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01843 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01843 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01843 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01843 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01843 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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