Protein–RNA interactions for Protein: P01823

Ig heavy chain V region 36-60, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01823 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01823 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01823 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01823 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01823 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01823 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01823 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01823 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01823 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01823 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01823 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01823 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01823 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01823 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
P01823 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01823 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01823 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01823 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01823 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01823 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01823 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01823 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01823 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01823 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
P01823 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01823 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01823 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
P01823 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01823 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01823 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01823 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01823 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01823 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01823 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01823 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01823 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01823 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01823 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01823 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01823 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01823 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01823 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01823 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01823 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01823 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01823 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01823 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01823 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P01823 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01823 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01823 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01823 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01823 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01823 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01823 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01823 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01823 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01823 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01823 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01823 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01823 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01823 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01823 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01823 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01823 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01823 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01823 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01823 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01823 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01823 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01823 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01823 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01823 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01823 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01823 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01823 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01823 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P01823 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01823 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01823 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01823 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01823 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01823 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01823 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01823 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01823 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01823 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
P01823 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01823 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01823 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01823 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01823 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01823 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01823 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01823 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01823 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01823 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01823 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01823 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01823 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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