Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms