Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Apaf1O88879 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Apaf1O88879 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Apaf1O88879 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms