Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cops6O88545 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cops6O88545 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cops6O88545 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cops6O88545 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cops6O88545 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cops6O88545 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cops6O88545 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cops6O88545 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Cops6O88545 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cops6O88545 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cops6O88545 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cops6O88545 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cops6O88545 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cops6O88545 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cops6O88545 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Cops6O88545 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cops6O88545 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cops6O88545 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cops6O88545 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cops6O88545 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cops6O88545 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cops6O88545 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cops6O88545 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cops6O88545 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cops6O88545 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cops6O88545 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Cops6O88545 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cops6O88545 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Cops6O88545 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cops6O88545 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cops6O88545 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cops6O88545 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cops6O88545 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cops6O88545 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cops6O88545 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cops6O88545 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cops6O88545 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cops6O88545 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cops6O88545 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cops6O88545 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cops6O88545 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cops6O88545 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cops6O88545 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cops6O88545 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cops6O88545 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cops6O88545 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cops6O88545 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Cops6O88545 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cops6O88545 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Cops6O88545 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cops6O88545 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cops6O88545 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cops6O88545 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cops6O88545 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cops6O88545 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cops6O88545 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cops6O88545 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cops6O88545 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cops6O88545 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cops6O88545 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cops6O88545 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cops6O88545 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cops6O88545 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cops6O88545 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cops6O88545 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cops6O88545 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cops6O88545 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Cops6O88545 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cops6O88545 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cops6O88545 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cops6O88545 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cops6O88545 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cops6O88545 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cops6O88545 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cops6O88545 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cops6O88545 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cops6O88545 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cops6O88545 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cops6O88545 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cops6O88545 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cops6O88545 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cops6O88545 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cops6O88545 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cops6O88545 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cops6O88545 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cops6O88545 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cops6O88545 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cops6O88545 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cops6O88545 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cops6O88545 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cops6O88545 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cops6O88545 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cops6O88545 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cops6O88545 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cops6O88545 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Cops6O88545 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cops6O88545 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cops6O88545 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cops6O88545 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms