Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CntfrO88507 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CntfrO88507 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CntfrO88507 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CntfrO88507 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CntfrO88507 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CntfrO88507 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CntfrO88507 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CntfrO88507 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms