Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vti1bO88384 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vti1bO88384 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vti1bO88384 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vti1bO88384 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vti1bO88384 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Vti1bO88384 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vti1bO88384 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vti1bO88384 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vti1bO88384 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms