Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctnnal1O88327 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctnnal1O88327 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctnnal1O88327 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctnnal1O88327 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctnnal1O88327 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctnnal1O88327 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctnnal1O88327 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctnnal1O88327 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ctnnal1O88327 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ctnnal1O88327 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ctnnal1O88327 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctnnal1O88327 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctnnal1O88327 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctnnal1O88327 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctnnal1O88327 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctnnal1O88327 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctnnal1O88327 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctnnal1O88327 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctnnal1O88327 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctnnal1O88327 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctnnal1O88327 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctnnal1O88327 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctnnal1O88327 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctnnal1O88327 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctnnal1O88327 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctnnal1O88327 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctnnal1O88327 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctnnal1O88327 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctnnal1O88327 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctnnal1O88327 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctnnal1O88327 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctnnal1O88327 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ctnnal1O88327 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms