Protein–RNA interactions for Protein: O70572

Smpd2, Sphingomyelin phosphodiesterase 2, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd2O70572 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smpd2O70572 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smpd2O70572 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smpd2O70572 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Smpd2O70572 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Smpd2O70572 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smpd2O70572 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smpd2O70572 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smpd2O70572 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smpd2O70572 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smpd2O70572 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smpd2O70572 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Smpd2O70572 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smpd2O70572 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smpd2O70572 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smpd2O70572 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smpd2O70572 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Smpd2O70572 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smpd2O70572 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Smpd2O70572 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Smpd2O70572 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smpd2O70572 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smpd2O70572 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smpd2O70572 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smpd2O70572 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smpd2O70572 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms