Protein–RNA interactions for Protein: O70481

Ubr1, E3 ubiquitin-protein ligase UBR1, mousemouse

Predictions only

Length 1,757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr1O70481 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ubr1O70481 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ubr1O70481 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ubr1O70481 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ubr1O70481 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ubr1O70481 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ubr1O70481 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ubr1O70481 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ubr1O70481 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ubr1O70481 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ubr1O70481 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Ubr1O70481 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ubr1O70481 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ubr1O70481 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ubr1O70481 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ubr1O70481 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ubr1O70481 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Ubr1O70481 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Ubr1O70481 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ubr1O70481 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ubr1O70481 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Ubr1O70481 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ubr1O70481 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ubr1O70481 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ubr1O70481 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ubr1O70481 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ubr1O70481 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ubr1O70481 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ubr1O70481 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ubr1O70481 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ubr1O70481 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ubr1O70481 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ubr1O70481 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Ubr1O70481 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ubr1O70481 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ubr1O70481 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ubr1O70481 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ubr1O70481 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ubr1O70481 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ubr1O70481 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ubr1O70481 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ubr1O70481 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ubr1O70481 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ubr1O70481 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ubr1O70481 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ubr1O70481 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ubr1O70481 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ubr1O70481 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ubr1O70481 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ubr1O70481 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ubr1O70481 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ubr1O70481 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Ubr1O70481 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Ubr1O70481 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ubr1O70481 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ubr1O70481 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ubr1O70481 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ubr1O70481 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ubr1O70481 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ubr1O70481 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ubr1O70481 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ubr1O70481 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ubr1O70481 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Ubr1O70481 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ubr1O70481 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ubr1O70481 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ubr1O70481 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ubr1O70481 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ubr1O70481 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ubr1O70481 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ubr1O70481 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ubr1O70481 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ubr1O70481 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ubr1O70481 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ubr1O70481 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ubr1O70481 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ubr1O70481 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ubr1O70481 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Ubr1O70481 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ubr1O70481 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ubr1O70481 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ubr1O70481 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ubr1O70481 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ubr1O70481 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ubr1O70481 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ubr1O70481 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ubr1O70481 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ubr1O70481 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ubr1O70481 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ubr1O70481 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ubr1O70481 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ubr1O70481 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ubr1O70481 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ubr1O70481 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ubr1O70481 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ubr1O70481 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ubr1O70481 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ubr1O70481 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ubr1O70481 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ubr1O70481 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms