Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Xirp1O70373 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Xirp1O70373 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Xirp1O70373 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Xirp1O70373 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Xirp1O70373 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Xirp1O70373 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Xirp1O70373 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Xirp1O70373 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Xirp1O70373 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Xirp1O70373 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xirp1O70373 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xirp1O70373 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xirp1O70373 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Xirp1O70373 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xirp1O70373 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xirp1O70373 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xirp1O70373 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xirp1O70373 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xirp1O70373 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xirp1O70373 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Xirp1O70373 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Xirp1O70373 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Xirp1O70373 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Xirp1O70373 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Xirp1O70373 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Xirp1O70373 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Xirp1O70373 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Xirp1O70373 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xirp1O70373 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xirp1O70373 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xirp1O70373 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xirp1O70373 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Xirp1O70373 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Xirp1O70373 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Xirp1O70373 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Xirp1O70373 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Xirp1O70373 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xirp1O70373 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xirp1O70373 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xirp1O70373 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xirp1O70373 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xirp1O70373 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xirp1O70373 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xirp1O70373 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xirp1O70373 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xirp1O70373 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xirp1O70373 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xirp1O70373 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xirp1O70373 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xirp1O70373 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xirp1O70373 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xirp1O70373 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xirp1O70373 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xirp1O70373 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xirp1O70373 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xirp1O70373 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xirp1O70373 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xirp1O70373 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xirp1O70373 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xirp1O70373 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xirp1O70373 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xirp1O70373 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xirp1O70373 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xirp1O70373 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xirp1O70373 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xirp1O70373 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Xirp1O70373 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Xirp1O70373 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Xirp1O70373 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xirp1O70373 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xirp1O70373 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xirp1O70373 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xirp1O70373 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xirp1O70373 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xirp1O70373 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xirp1O70373 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xirp1O70373 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xirp1O70373 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xirp1O70373 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xirp1O70373 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xirp1O70373 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xirp1O70373 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xirp1O70373 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xirp1O70373 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xirp1O70373 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xirp1O70373 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xirp1O70373 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xirp1O70373 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xirp1O70373 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xirp1O70373 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xirp1O70373 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xirp1O70373 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xirp1O70373 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xirp1O70373 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xirp1O70373 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xirp1O70373 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xirp1O70373 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms