Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rpl35aO55142 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rpl35aO55142 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rpl35aO55142 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rpl35aO55142 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rpl35aO55142 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rpl35aO55142 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rpl35aO55142 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rpl35aO55142 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rpl35aO55142 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rpl35aO55142 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl35aO55142 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl35aO55142 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl35aO55142 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rpl35aO55142 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rpl35aO55142 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rpl35aO55142 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl35aO55142 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl35aO55142 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rpl35aO55142 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rpl35aO55142 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl35aO55142 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl35aO55142 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl35aO55142 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl35aO55142 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl35aO55142 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl35aO55142 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl35aO55142 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl35aO55142 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl35aO55142 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl35aO55142 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl35aO55142 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl35aO55142 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl35aO55142 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl35aO55142 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl35aO55142 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl35aO55142 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl35aO55142 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl35aO55142 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl35aO55142 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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