Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NlkO54949 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NlkO54949 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NlkO54949 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NlkO54949 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NlkO54949 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NlkO54949 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NlkO54949 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NlkO54949 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NlkO54949 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NlkO54949 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NlkO54949 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NlkO54949 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NlkO54949 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NlkO54949 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NlkO54949 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NlkO54949 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NlkO54949 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NlkO54949 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NlkO54949 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NlkO54949 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NlkO54949 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NlkO54949 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NlkO54949 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NlkO54949 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NlkO54949 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NlkO54949 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NlkO54949 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NlkO54949 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NlkO54949 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NlkO54949 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NlkO54949 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NlkO54949 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NlkO54949 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NlkO54949 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NlkO54949 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NlkO54949 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NlkO54949 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NlkO54949 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NlkO54949 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NlkO54949 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NlkO54949 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NlkO54949 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NlkO54949 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NlkO54949 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NlkO54949 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NlkO54949 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NlkO54949 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NlkO54949 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NlkO54949 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NlkO54949 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NlkO54949 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NlkO54949 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NlkO54949 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NlkO54949 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NlkO54949 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NlkO54949 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NlkO54949 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NlkO54949 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NlkO54949 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NlkO54949 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NlkO54949 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NlkO54949 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NlkO54949 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NlkO54949 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NlkO54949 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NlkO54949 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NlkO54949 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NlkO54949 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NlkO54949 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NlkO54949 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NlkO54949 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NlkO54949 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NlkO54949 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NlkO54949 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NlkO54949 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NlkO54949 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NlkO54949 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NlkO54949 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NlkO54949 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NlkO54949 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NlkO54949 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NlkO54949 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NlkO54949 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NlkO54949 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NlkO54949 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NlkO54949 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NlkO54949 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NlkO54949 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NlkO54949 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NlkO54949 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NlkO54949 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NlkO54949 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NlkO54949 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NlkO54949 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NlkO54949 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NlkO54949 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NlkO54949 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NlkO54949 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NlkO54949 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms