Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxO54751 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxO54751 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CrxO54751 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CrxO54751 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CrxO54751 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CrxO54751 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CrxO54751 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CrxO54751 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CrxO54751 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CrxO54751 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CrxO54751 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CrxO54751 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CrxO54751 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CrxO54751 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CrxO54751 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CrxO54751 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CrxO54751 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CrxO54751 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CrxO54751 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CrxO54751 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CrxO54751 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CrxO54751 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CrxO54751 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CrxO54751 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CrxO54751 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CrxO54751 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CrxO54751 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CrxO54751 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CrxO54751 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CrxO54751 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CrxO54751 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CrxO54751 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CrxO54751 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CrxO54751 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CrxO54751 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CrxO54751 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CrxO54751 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CrxO54751 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CrxO54751 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CrxO54751 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxO54751 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxO54751 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxO54751 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxO54751 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxO54751 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxO54751 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxO54751 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxO54751 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxO54751 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CrxO54751 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CrxO54751 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CrxO54751 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CrxO54751 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CrxO54751 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CrxO54751 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CrxO54751 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CrxO54751 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CrxO54751 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CrxO54751 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CrxO54751 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CrxO54751 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CrxO54751 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CrxO54751 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CrxO54751 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CrxO54751 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CrxO54751 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CrxO54751 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CrxO54751 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CrxO54751 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CrxO54751 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CrxO54751 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CrxO54751 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CrxO54751 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CrxO54751 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CrxO54751 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxO54751 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxO54751 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxO54751 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxO54751 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxO54751 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxO54751 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxO54751 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxO54751 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxO54751 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxO54751 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CrxO54751 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CrxO54751 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CrxO54751 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CrxO54751 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CrxO54751 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CrxO54751 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CrxO54751 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CrxO54751 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CrxO54751 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CrxO54751 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CrxO54751 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CrxO54751 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CrxO54751 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CrxO54751 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms