Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sp100O35892 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sp100O35892 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sp100O35892 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sp100O35892 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sp100O35892 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sp100O35892 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sp100O35892 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sp100O35892 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sp100O35892 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sp100O35892 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sp100O35892 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sp100O35892 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sp100O35892 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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