Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cops5O35864 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cops5O35864 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cops5O35864 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cops5O35864 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cops5O35864 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cops5O35864 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cops5O35864 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cops5O35864 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cops5O35864 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Cops5O35864 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cops5O35864 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cops5O35864 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cops5O35864 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cops5O35864 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cops5O35864 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cops5O35864 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cops5O35864 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cops5O35864 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cops5O35864 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cops5O35864 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cops5O35864 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cops5O35864 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cops5O35864 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cops5O35864 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cops5O35864 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cops5O35864 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cops5O35864 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cops5O35864 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cops5O35864 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cops5O35864 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cops5O35864 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cops5O35864 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cops5O35864 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cops5O35864 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cops5O35864 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cops5O35864 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cops5O35864 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cops5O35864 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cops5O35864 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cops5O35864 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cops5O35864 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cops5O35864 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cops5O35864 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cops5O35864 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cops5O35864 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cops5O35864 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cops5O35864 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms