Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cited2O35740 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cited2O35740 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cited2O35740 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cited2O35740 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cited2O35740 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cited2O35740 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cited2O35740 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cited2O35740 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cited2O35740 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cited2O35740 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cited2O35740 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cited2O35740 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cited2O35740 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cited2O35740 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cited2O35740 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cited2O35740 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cited2O35740 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cited2O35740 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cited2O35740 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cited2O35740 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cited2O35740 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cited2O35740 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cited2O35740 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cited2O35740 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cited2O35740 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cited2O35740 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cited2O35740 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cited2O35740 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms