Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf9O35739 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf9O35739 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf9O35739 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf9O35739 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf9O35739 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf9O35739 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf9O35739 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf9O35739 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf9O35739 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf9O35739 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf9O35739 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms