Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stag2O35638 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stag2O35638 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stag2O35638 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stag2O35638 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stag2O35638 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stag2O35638 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stag2O35638 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stag2O35638 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stag2O35638 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stag2O35638 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stag2O35638 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stag2O35638 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stag2O35638 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stag2O35638 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stag2O35638 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stag2O35638 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stag2O35638 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stag2O35638 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stag2O35638 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stag2O35638 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stag2O35638 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stag2O35638 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stag2O35638 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Stag2O35638 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Stag2O35638 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Stag2O35638 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Stag2O35638 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stag2O35638 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stag2O35638 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stag2O35638 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stag2O35638 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stag2O35638 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stag2O35638 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stag2O35638 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stag2O35638 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stag2O35638 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stag2O35638 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stag2O35638 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stag2O35638 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stag2O35638 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Stag2O35638 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stag2O35638 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stag2O35638 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stag2O35638 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stag2O35638 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stag2O35638 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stag2O35638 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stag2O35638 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Stag2O35638 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stag2O35638 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stag2O35638 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stag2O35638 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stag2O35638 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Stag2O35638 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stag2O35638 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stag2O35638 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stag2O35638 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stag2O35638 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stag2O35638 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stag2O35638 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stag2O35638 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stag2O35638 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stag2O35638 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stag2O35638 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stag2O35638 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stag2O35638 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stag2O35638 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stag2O35638 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stag2O35638 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stag2O35638 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stag2O35638 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stag2O35638 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stag2O35638 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stag2O35638 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stag2O35638 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Stag2O35638 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stag2O35638 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Stag2O35638 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stag2O35638 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stag2O35638 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stag2O35638 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stag2O35638 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stag2O35638 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stag2O35638 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stag2O35638 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stag2O35638 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stag2O35638 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stag2O35638 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stag2O35638 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stag2O35638 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stag2O35638 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stag2O35638 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Stag2O35638 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stag2O35638 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stag2O35638 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stag2O35638 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stag2O35638 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stag2O35638 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stag2O35638 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms