Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clk2O35491 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clk2O35491 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clk2O35491 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clk2O35491 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Clk2O35491 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clk2O35491 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clk2O35491 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clk2O35491 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clk2O35491 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Clk2O35491 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clk2O35491 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clk2O35491 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clk2O35491 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clk2O35491 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clk2O35491 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clk2O35491 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Clk2O35491 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clk2O35491 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clk2O35491 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clk2O35491 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clk2O35491 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clk2O35491 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clk2O35491 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clk2O35491 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clk2O35491 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clk2O35491 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clk2O35491 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clk2O35491 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clk2O35491 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clk2O35491 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clk2O35491 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clk2O35491 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clk2O35491 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clk2O35491 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clk2O35491 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clk2O35491 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clk2O35491 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clk2O35491 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clk2O35491 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clk2O35491 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Clk2O35491 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clk2O35491 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clk2O35491 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162 ms