Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KeraO35367 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KeraO35367 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KeraO35367 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KeraO35367 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KeraO35367 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KeraO35367 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KeraO35367 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KeraO35367 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KeraO35367 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KeraO35367 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KeraO35367 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KeraO35367 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KeraO35367 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KeraO35367 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KeraO35367 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KeraO35367 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KeraO35367 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KeraO35367 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KeraO35367 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KeraO35367 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KeraO35367 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KeraO35367 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KeraO35367 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KeraO35367 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KeraO35367 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KeraO35367 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KeraO35367 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KeraO35367 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KeraO35367 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KeraO35367 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KeraO35367 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KeraO35367 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KeraO35367 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KeraO35367 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KeraO35367 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KeraO35367 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KeraO35367 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KeraO35367 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KeraO35367 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KeraO35367 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KeraO35367 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KeraO35367 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KeraO35367 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KeraO35367 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KeraO35367 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KeraO35367 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KeraO35367 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KeraO35367 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KeraO35367 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KeraO35367 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KeraO35367 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KeraO35367 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KeraO35367 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KeraO35367 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KeraO35367 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KeraO35367 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KeraO35367 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KeraO35367 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KeraO35367 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KeraO35367 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KeraO35367 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KeraO35367 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KeraO35367 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KeraO35367 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KeraO35367 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KeraO35367 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KeraO35367 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KeraO35367 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KeraO35367 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KeraO35367 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KeraO35367 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KeraO35367 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KeraO35367 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KeraO35367 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KeraO35367 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KeraO35367 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KeraO35367 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KeraO35367 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KeraO35367 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KeraO35367 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KeraO35367 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KeraO35367 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KeraO35367 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KeraO35367 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KeraO35367 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KeraO35367 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KeraO35367 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KeraO35367 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KeraO35367 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KeraO35367 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KeraO35367 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KeraO35367 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KeraO35367 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KeraO35367 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KeraO35367 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KeraO35367 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KeraO35367 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KeraO35367 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KeraO35367 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms