Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc23O35125 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc23O35125 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc23O35125 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc23O35125 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc23O35125 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc23O35125 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrc23O35125 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrc23O35125 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrc23O35125 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrc23O35125 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc23O35125 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc23O35125 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc23O35125 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc23O35125 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc23O35125 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc23O35125 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc23O35125 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc23O35125 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc23O35125 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc23O35125 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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