Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Casq1O09165 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Casq1O09165 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Casq1O09165 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Casq1O09165 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Casq1O09165 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Casq1O09165 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Casq1O09165 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Casq1O09165 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Casq1O09165 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Casq1O09165 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Casq1O09165 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Casq1O09165 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Casq1O09165 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Casq1O09165 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Casq1O09165 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casq1O09165 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casq1O09165 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casq1O09165 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casq1O09165 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casq1O09165 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casq1O09165 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casq1O09165 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casq1O09165 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casq1O09165 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casq1O09165 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casq1O09165 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casq1O09165 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Casq1O09165 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casq1O09165 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casq1O09165 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casq1O09165 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Casq1O09165 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Casq1O09165 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Casq1O09165 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Casq1O09165 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Casq1O09165 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Casq1O09165 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Casq1O09165 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Casq1O09165 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Casq1O09165 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Casq1O09165 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Casq1O09165 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Casq1O09165 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Casq1O09165 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Casq1O09165 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Casq1O09165 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Casq1O09165 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Casq1O09165 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Casq1O09165 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casq1O09165 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casq1O09165 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casq1O09165 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Casq1O09165 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Casq1O09165 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Casq1O09165 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Casq1O09165 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Casq1O09165 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Casq1O09165 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Casq1O09165 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms