Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sypl1O09117 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sypl1O09117 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms