Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Snap23O09044 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Snap23O09044 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Snap23O09044 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Snap23O09044 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Snap23O09044 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Snap23O09044 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Snap23O09044 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Snap23O09044 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Snap23O09044 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Snap23O09044 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Snap23O09044 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Snap23O09044 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Snap23O09044 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Snap23O09044 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Snap23O09044 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Snap23O09044 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Snap23O09044 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Snap23O09044 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Snap23O09044 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Snap23O09044 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Snap23O09044 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Snap23O09044 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Snap23O09044 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Snap23O09044 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Snap23O09044 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Snap23O09044 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Snap23O09044 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Snap23O09044 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Snap23O09044 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Snap23O09044 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Snap23O09044 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Snap23O09044 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Snap23O09044 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Snap23O09044 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Snap23O09044 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Snap23O09044 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Snap23O09044 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Snap23O09044 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Snap23O09044 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Snap23O09044 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Snap23O09044 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Snap23O09044 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Snap23O09044 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Snap23O09044 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Snap23O09044 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Snap23O09044 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Snap23O09044 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Snap23O09044 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Snap23O09044 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Snap23O09044 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Snap23O09044 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Snap23O09044 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Snap23O09044 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Snap23O09044 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Snap23O09044 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Snap23O09044 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Snap23O09044 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Snap23O09044 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Snap23O09044 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Snap23O09044 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Snap23O09044 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Snap23O09044 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Snap23O09044 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Snap23O09044 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Snap23O09044 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Snap23O09044 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Snap23O09044 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Snap23O09044 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Snap23O09044 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Snap23O09044 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Snap23O09044 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Snap23O09044 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Snap23O09044 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Snap23O09044 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Snap23O09044 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Snap23O09044 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Snap23O09044 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Snap23O09044 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Snap23O09044 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Snap23O09044 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Snap23O09044 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Snap23O09044 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Snap23O09044 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Snap23O09044 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Snap23O09044 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Snap23O09044 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Snap23O09044 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Snap23O09044 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Snap23O09044 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Snap23O09044 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Snap23O09044 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Snap23O09044 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Snap23O09044 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Snap23O09044 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Snap23O09044 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Snap23O09044 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Snap23O09044 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Snap23O09044 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Snap23O09044 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.1 ms