Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Eftud2O08810 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eftud2O08810 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eftud2O08810 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eftud2O08810 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eftud2O08810 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eftud2O08810 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Eftud2O08810 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Eftud2O08810 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Eftud2O08810 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Eftud2O08810 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Eftud2O08810 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Eftud2O08810 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Eftud2O08810 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Eftud2O08810 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Eftud2O08810 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Eftud2O08810 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Eftud2O08810 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Eftud2O08810 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Eftud2O08810 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Eftud2O08810 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms