Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tcof1O08784 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tcof1O08784 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tcof1O08784 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tcof1O08784 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tcof1O08784 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tcof1O08784 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tcof1O08784 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tcof1O08784 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tcof1O08784 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tcof1O08784 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tcof1O08784 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tcof1O08784 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tcof1O08784 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tcof1O08784 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tcof1O08784 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tcof1O08784 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tcof1O08784 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tcof1O08784 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tcof1O08784 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tcof1O08784 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tcof1O08784 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tcof1O08784 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tcof1O08784 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tcof1O08784 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tcof1O08784 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tcof1O08784 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tcof1O08784 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tcof1O08784 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tcof1O08784 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tcof1O08784 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tcof1O08784 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tcof1O08784 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tcof1O08784 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tcof1O08784 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tcof1O08784 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tcof1O08784 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tcof1O08784 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms