Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casp12O08736 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casp12O08736 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Casp12O08736 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Casp12O08736 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casp12O08736 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casp12O08736 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casp12O08736 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casp12O08736 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casp12O08736 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casp12O08736 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casp12O08736 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casp12O08736 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Casp12O08736 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Casp12O08736 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Casp12O08736 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Casp12O08736 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Casp12O08736 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Casp12O08736 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Casp12O08736 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Casp12O08736 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Casp12O08736 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Casp12O08736 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Casp12O08736 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Casp12O08736 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Casp12O08736 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Casp12O08736 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Casp12O08736 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Casp12O08736 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Casp12O08736 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Casp12O08736 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casp12O08736 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casp12O08736 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casp12O08736 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casp12O08736 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casp12O08736 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casp12O08736 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casp12O08736 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casp12O08736 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casp12O08736 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Casp12O08736 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Casp12O08736 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Casp12O08736 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Casp12O08736 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Casp12O08736 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casp12O08736 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casp12O08736 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casp12O08736 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casp12O08736 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casp12O08736 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Casp12O08736 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Casp12O08736 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Casp12O08736 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Casp12O08736 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Casp12O08736 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Casp12O08736 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Casp12O08736 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Casp12O08736 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Casp12O08736 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Casp12O08736 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casp12O08736 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casp12O08736 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casp12O08736 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casp12O08736 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casp12O08736 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casp12O08736 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Casp12O08736 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Casp12O08736 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Casp12O08736 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Casp12O08736 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms