Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CltaO08585 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CltaO08585 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CltaO08585 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CltaO08585 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CltaO08585 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CltaO08585 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CltaO08585 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CltaO08585 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CltaO08585 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CltaO08585 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CltaO08585 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CltaO08585 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CltaO08585 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CltaO08585 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CltaO08585 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CltaO08585 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CltaO08585 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CltaO08585 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CltaO08585 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CltaO08585 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CltaO08585 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CltaO08585 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CltaO08585 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CltaO08585 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CltaO08585 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CltaO08585 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CltaO08585 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CltaO08585 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CltaO08585 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CltaO08585 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CltaO08585 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CltaO08585 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CltaO08585 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CltaO08585 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CltaO08585 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CltaO08585 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CltaO08585 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CltaO08585 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CltaO08585 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CltaO08585 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CltaO08585 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CltaO08585 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CltaO08585 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CltaO08585 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CltaO08585 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CltaO08585 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CltaO08585 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CltaO08585 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CltaO08585 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CltaO08585 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CltaO08585 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CltaO08585 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CltaO08585 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CltaO08585 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CltaO08585 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CltaO08585 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CltaO08585 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CltaO08585 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CltaO08585 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CltaO08585 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CltaO08585 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CltaO08585 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CltaO08585 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CltaO08585 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CltaO08585 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CltaO08585 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CltaO08585 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CltaO08585 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CltaO08585 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CltaO08585 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CltaO08585 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CltaO08585 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CltaO08585 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CltaO08585 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CltaO08585 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CltaO08585 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CltaO08585 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CltaO08585 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CltaO08585 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CltaO08585 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CltaO08585 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CltaO08585 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CltaO08585 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CltaO08585 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CltaO08585 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CltaO08585 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CltaO08585 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CltaO08585 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CltaO08585 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CltaO08585 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CltaO08585 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CltaO08585 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CltaO08585 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CltaO08585 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CltaO08585 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CltaO08585 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CltaO08585 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CltaO08585 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CltaO08585 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms