Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ascl4M0QW46 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ascl4M0QW46 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms