Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm2888K7N746 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm2888K7N746 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm2888K7N746 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm2888K7N746 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm2888K7N746 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm2888K7N746 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm2888K7N746 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm2888K7N746 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm2888K7N746 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm2888K7N746 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm2888K7N746 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm2888K7N746 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm2888K7N746 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm2888K7N746 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm2888K7N746 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm2888K7N746 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm2888K7N746 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm2888K7N746 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm2888K7N746 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm2888K7N746 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm2888K7N746 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm2888K7N746 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm2888K7N746 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm2888K7N746 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm2888K7N746 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm2888K7N746 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm2888K7N746 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm2888K7N746 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm2888K7N746 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm2888K7N746 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm2888K7N746 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm2888K7N746 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm2888K7N746 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm2888K7N746 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm2888K7N746 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm2888K7N746 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm2888K7N746 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm2888K7N746 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm2888K7N746 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm2888K7N746 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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