Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm379J3QQ19 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm379J3QQ19 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm379J3QQ19 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm379J3QQ19 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm379J3QQ19 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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Gm379J3QQ19 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm379J3QQ19 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm379J3QQ19 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm379J3QQ19 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm379J3QQ19 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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Gm379J3QQ19 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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Gm379J3QQ19 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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Gm379J3QQ19 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm379J3QQ19 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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Gm379J3QQ19 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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Gm379J3QQ19 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Gm379J3QQ19 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Gm379J3QQ19 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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Gm379J3QQ19 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Gm379J3QQ19 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Gm379J3QQ19 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Gm379J3QQ19 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Gm379J3QQ19 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm379J3QQ19 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm379J3QQ19 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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